Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- s -

• s : UMol.ModelsPlayer , UMol.TrajectoryPlayer
• s1 : UMol.pairString
• s2 : UMol.pairString
• sameAtoms() : UMol.UnityMolAnnotationManager
• savedColors : UMol.CartoonRepresentation
• saveDockingState() : UMol.DockingManager
• saveHistoryScript() : UMol.API.APIPython
• saveState() : UMol.ReadSaveFilesWithBrowser
• saveStateAsPythonScript() : UMol.UIManager
• Scale() : MeshData
• scale : UMol.BondRepresentationOptihs , UMol.UnityMolAtom
• scaleBond : UMol.UnityMolHStickMeshManager
• scaleFactor : VRTK.VRTK_StraightPointerRendererNoRB
• screenshot() : UMol.API.APIPython
• scrollSpeed : UMol.ManipulationManager
• SDFextensions : UMol.SDFReader
• SDFReader() : UMol.SDFReader
• searchClosestAtom() : UMol.NeighborSearchWrapper
• secondaryStructure : UMol.UnityMolResidue
• SecondaryStructureSelection() : UMol.SecondaryStructureSelection
• secondaryStructureType : UMol.UnityMolResidue
• secondController : GeometricalSelection
• Segment() : UMol.Segment
• sel : UMol.AroundSelection , UMol.UnarySelection
• select() : UMol.API.APIPython
• selectActiveSite() : UMol.UIManager
• selectActiveSiteAndLigand() : UMol.UIManager
• selectCurrentResidue() : UMol.QuickSelectionUI
• selectInSphere() : UMol.API.APIPython
• selection : UMol.AtomRepresentation , UMol.BondRepresentation , UMol.UnityMolRepresentation
• selectionKeywords : UMol.MDAnalysisSelection
• selectionMDAKeywords : UMol.UnityMolSelectionManager
• SelectionMode : UMol.UnityMolSelectionManager
• selectionMode : UMol.UnityMolSelectionManager
• selectionNameToStructure() : UMol.UnityMolStructureManager
• SelectionParser() : UMol.SelectionParser
• selections : UMol.UnityMolSelectionManager
• SelectionSelection() : UMol.SelectionSelection
• selectionStr : UMol.MDAnalysisSelection
• selectionsUITransform : UMol.UIManager
• selectionToUIObject : UMol.UIManager
• send_forces() : UMol.ArtemisManager , UMol.ArtemisThreadedClient
• send_position_restraint() : UMol.ArtemisManager , UMol.ArtemisThreadedClient
• send_position_restraint_delete() : UMol.ArtemisManager , UMol.ArtemisThreadedClient
• send_restraint() : UMol.ArtemisManager , UMol.ArtemisThreadedClient
• send_restraint_delete() : UMol.ArtemisManager , UMol.ArtemisThreadedClient
• sendKey() : KeyboardUI
• seqUIGo : UMol.UIManager
• seqViewer : UMol.UIManager
• SetAlpha() : UMol.UnityMolSurfaceManager
• setAsLigand() : UMol.API.APIPython
• SetAtomRepresentationModel() : UMol.UnityMolAtom
• setCameraFarPlane() : UMol.API.APIPython
• setCameraNearPlane() : UMol.API.APIPython
• setCartoonColorSS() : UMol.API.APIPython
• SetColor() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolRepresentation , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• SetColorForAtom() : UMol.UnityMolHStickMeshManager
• SetColors() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolRepresentation , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• setCurrentSelection() : UMol.API.APIPython
• SetCurrentSelection() : UMol.UnityMolSelectionManager
• SetCurrentStructure() : UMol.UnityMolStructureManager
• SetDistanceCueing() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• SetEndColor() : UMol.FieldLinesRepresentationManager
• SetForceField() : ForceFieldsManager
• setHyperBallMetaphore() : UMol.API.APIPython
• setHyperBallShininess() : UMol.API.APIPython
• setHyperballShrink() : UMol.API.APIPython
• setHyperballTexture() : UMol.API.APIPython
• SetImplementation() : UMol.Docking.NBEnergetics
• setIPD() : UMol.UIManager
• setIPDZero() : UMol.UIManager
• SetLengthLine() : UMol.FieldLinesRepresentationManager
• setLineSize() : UMol.API.APIPython
• setMetal() : UMol.API.APIPython
• SetMetal() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• setModel() : UMol.API.APIPython , UMol.UnityMolStructure
• setMolParentTransform() : UMol.API.APIPython
• setMouseMoveSpeed() : UMol.API.APIPython
• setMouseScrollSpeed() : UMol.API.APIPython
• SetPointerAppearance() : VRTK.VRTK_StraightPointerRendererNoRB
• setPosScaleRot() : UMol.API.APIPython
• setRepSize() : UMol.API.APIPython
• SetResidue() : UMol.UnityMolAtom
• setRotationCenter() : UMol.API.APIPython , UMol.ManipulationManager
• SetScale() : UMol.UnityMolHBallMeshManager
• setScaleBond() : UMol.UnityMolHStickMeshManager
• SetScaleForAtom() : UMol.UnityMolHStickMeshManager
• setSelectedOject() : UMol.ManipulationManager
• SetShininess() : UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager
• SetShrink() : UMol.UnityMolHStickMeshManager
• SetSize() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolRepresentation , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• SetSizes() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolRepresentation , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• SetSliderTextValue() : SliderTextUpdate
• setSmoothness() : UMol.API.APIPython
• SetSmoothness() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• setSolidSurface() : UMol.API.APIPython
• SetSpeedLine() : UMol.FieldLinesRepresentationManager
• SetStartColor() : UMol.FieldLinesRepresentationManager
• SetStartEndColors() : UMol.FieldLinesRepresentationManager
• setStructureGroup() : UMol.API.APIPython
• SetTexture() : UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager
• setTransparentSurface() : UMol.API.APIPython
• Setup() : UMol.Docking.DockingNBEnergyThread
• setWidth() : MeshLineRenderer
• SetWidth() : UMol.UnityMolBondLineManager
• setWireframeSurface() : UMol.API.APIPython
• shininess : UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager
• Show() : UMol.AngleAnnotation
• show() : UMol.API.APIPython
• Show() : UMol.ArcLineAnnotation , UMol.ArrowAnnotation , UMol.DistanceAnnotation , UMol.DrawAnnotation , UMol.LineAtomAnnotation , UMol.SoundAnnotation , UMol.SphereAnnotation , UMol.TextAnnotation , UMol.TorsionAngleAnnotation , UMol.UnityMolAnnotation , UMol.UnityMolAnnotationManager , UMol.UnityMolRepresentation
• showAsIsoSurface() : UMol.DXReader
• ShowAtom() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolRepresentation , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• ShowAtoms() : UMol.UnityMolBondLineManager
• ShowBackbone() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• showBond() : UMol.UnityMolHStickMeshManager
• ShowBondForAtom() : UMol.UnityMolHStickMeshManager
• showDefault() : UMol.API.APIPython
• showHbondInterface() : UMol.UIManager
• showHideBackboneInSelection() : UMol.API.APIPython
• showHideBB() : UMol.UIManager
• showHideH() : UMol.UIManager
• showHideHydrogensInSelection() : UMol.API.APIPython
• showHideSC() : UMol.UIManager
• showHideSideChainsInSelection() : UMol.API.APIPython
• ShowHydrogens() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• showSelection() : UMol.API.APIPython
• ShowShadows() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolRepresentation , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• ShowSideChains() : UMol.FieldLinesRepresentationManager , UMol.UnityMolBondLineManager , UMol.UnityMolCartoonManager , UMol.UnityMolGenericRepresentationManager , UMol.UnityMolHBallMeshManager , UMol.UnityMolHbondManager , UMol.UnityMolHStickMeshManager , UMol.UnityMolSphereManager , UMol.UnityMolSurfaceManager
• showSphereHovering : UMol.MouseOverSelection
• showStructureAllRepresentations() : UMol.API.APIPython
• shrink : UMol.BondRepresentationOptihs , UMol.UnityMolHStickMeshManager
• Shuffle() : BenTools.Mathematics.MathTools
• ShuffleIList() : BenTools.Mathematics.MathTools
• side : UMol.DNAPlane , UMol.PeptidePlane
• sigma : ForceFields.FFAtomType
• size : chain , pdb , residue
• sizeLine : UMol.ArcLineAnnotation , UMol.DrawAnnotation , UMol.LineAtomAnnotation
• sizeOfPartition : UMol.Docking.NBEnergetics
• slP : UMol.MDAnalysisSelection
• smoothing : UMol.TrajectoryPlayer
• SmoothLine() : LineSmoother
• SnapObjectToGrabToController() : VRTK.GrabAttachMechanics.VRTK_GrabByChild
• spawner : CollisionsVRDocking
• SpawnExplosion() : ExplosionSpawner
• specialCL : UMol.IonsSelection
• specialHG : UMol.IonsSelection
• speed : AnimateTorsionAngle
• speedAnim : AnimateHbonds
• speedLine : UMol.FieldLinesRepresentation
• speedScale : UMol.GrapplingHookMolecule
• speedX : UMol.ManipulationManager
• speedY : UMol.ManipulationManager
• speedZ : UMol.ManipulationManager
• splineSteps : UMol.RibbonMesh , UMol.RibbonMeshDNA
• splitModelsInStructures() : UMol.UnityMolStructure
• sq_threshold : UMol.Docking.NBEnergetics
• SquaredLength : BenTools.Mathematics.Vector
• ssInfoFromFile : UMol.UnityMolStructure
• SSType : UMol.DSSP_Bridge
• ssType : UMol.SecondaryStructureSelection
• Start() : UMol.Docking.DockingNBEnergyThread
• start : UMol.Reader.secStruct
• startColor : UMol.FieldLinesRepresentation
• startDockingMode() : UMol.DockingManager
• StartGrab() : VRTK.GrabAttachMechanics.VRTK_GrabByChild
• StartRecording() : FFmpegOut.CameraRecord
• startScreenshotSequence() : ScreenShot
• startVideo() : UMol.API.APIPython
• stateToRead() : UMol.ReadSaveFilesWithBrowser
• step : UMol.XDRFileReader.FrameInfo
• stop() : UMol.ArtemisThreadedClient
• stop_simulation() : UMol.ArtemisManager , UMol.ArtemisThreadedClient
• stopDockingMode() : UMol.DockingManager
• StopGrab() : VRTK.GrabAttachMechanics.VRTK_GrabByChild
• StopRecording() : FFmpegOut.CameraRecord
• stopRotations() : UMol.API.APIPython
• stopScreenshotSequence() : ScreenShot
• stopVideo() : UMol.API.APIPython
• storeEnergies() : UMol.DSSP
• strandCol : UMol.RibbonMesh , UMol.RibbonMeshDNA
• StringSelection() : UMol.StringSelection
• structure : UMol.ArtemisManager , UMol.DXReader , UMol.UnityMolModel , UMol.XDRFileReader
• StructureNameSelection() : UMol.StructureNameSelection
• structureNameToUIObject : UMol.UIManager
• structures : UMol.Docking.DockingNBEnergyThread , UMol.UnityMolSelection
• structureToGameObject : UMol.UnityMolStructureManager
• structureType : UMol.UnityMolStructure
• subReps : UMol.UnityMolRepresentation
• subSelection : UMol.SubRepresentation
• subSelections : UMol.ISurfaceRepresentation
• suite : UMol.StringSelection
• sulphurColor : UMol.UnityMolDefaultColors
• SurfaceRepresentation() : UMol.SurfaceRepresentation
• surfMethod : UMol.SurfaceRepresentation
• switch3DStereo() : UMol.UIManager
• SwitchComputeMethod() : UMol.UnityMolSurfaceManager
• switchCutSurface() : UMol.API.APIPython
• SwitchCutSurface() : UMol.UnityMolSurfaceManager
• switchDockingMode() : UMol.UIManager
• switchDrawMode() : UMol.UIManager
• SwitchElements() : BenTools.Data.BinaryPriorityQueue
• switchOnOff() : SwitchOnOff
• switchRoomMode() : UMol.UIManager
• switchRotateAxisX() : UMol.API.APIPython
• switchRotateAxisY() : UMol.API.APIPython
• switchRotateAxisZ() : UMol.API.APIPython
• switchSelectionMode() : UMol.SwitchSelectionMode
• switchSeqViewer() : UMol.UIManager
• switchSurfaceComputeMethod() : UMol.API.APIPython
• SwitchTransparent() : UMol.UnityMolSurfaceManager
• SwitchWireframe() : UMol.UnityMolSurfaceManager
• sync_scene_with_frame() : UMol.XDRFileReader
• sync_scene_with_frame_smooth() : UMol.XDRFileReader
• Syncronized() : BenTools.Data.BinaryPriorityQueue
• SyncRoot : BenTools.Data.BinaryPriorityQueue , BenTools.Data.HashSet