janv. 2011

New paper out: X-ray structures of general anaesthetics bound to a pentameric ligand-gated ion channel

General anaesthetics have enjoyed long and widespread use but their molecular mechanism of action remains poorly understood. There is good evidence that their principal targets are pentameric ligand-gated ion channels1, 2 (pLGICs) such as inhibitory GABAA (γ-aminobutyric acid) receptors and excitatory nicotinic acetylcholine receptors, which are respectively potentiated and inhibited by general anaesthetics. The bacterial homologue from Gloeobacter violaceus3 (GLIC), whose X-ray structure was recently solved4, 5, is also sensitive to clinical concentrations of general anaesthetics6. Here we describe the crystal structures of the complexes propofol/GLIC and desflurane/GLIC.Read more...

Comment fonctionne un récepteur de neurotransmetteur au niveau atomique ?

Depuis de nombreuses années, les chercheurs du CNRS et de l'Institut Pasteur s’attardent à comprendre les mécanismes intervenant dans la communication entre les neurones du cerveau. Grâce à un système bactérien mimant le récepteur humain de la nicotine, ils ont réussi à simuler, au niveau atomique, les changements conformationnels intervenant dans la traduction du signal chimique apporté par le neurotransmetteur en un signal électrique, dans le neurone. Ces travaux ont donné lieu à une publication dans la revue PNAS le 22 mars 2010 et ouvrent la voie à la mise en place future de médicaments adaptés aux pathologies cérébrales comme le tabagisme. Plus de détais sur cette partie de mon site.

Joyeux Noël / Merry X-mas & DNase

Nos travaux sur la DNase I ont servi pour les voeux de l'IDRIS 2011. La carte animée en Flash est accessible sur ce site. Le message accompagnant la carte était "Le personnel de l'IDRIS vous présente ses meilleurs voeux pour la nouvelle année 2011".
Our work on the DNase I enzyme was featured in the IDRIS supercomputer center's 2011 season's greetings. The animated card is accessible from this site. The message going with it was "IDRIS team wishes you a happy new year 2011".

Mon mémoire d'HDR disponible en téléchargement

Vous pouvez télécharger mon mémoire HDR à partir de cette page. En résumé: La motivation première de mes travaux de recherche est de combiner des approches expérimentales et théoriques dans le domaine de la chimie physique pour atteindre une meilleure compréhension des phénomènes à l'échelle atomique. Mes travaux en cours traitent de systèmes d'intérêt biologique concernant les processus membranaires et des phénomènes accessibles par des méthodes de nanomanipulation. Les problèmes de la biophysique et biochimie sont au coeur de mes recherches. J'ai effectué des simulations complexes de protéines membranaires dans une bicouche lipidique qui se sont montrées tout à fait complémentaires et révélatrices par rapport aux études expérimentales de biologie structurale. Une récente collaboration exploitant cette complémentarité a donné lieu à une publication dans la revue Nature en début 2009. Les travaux récents visent à développer des approches combinant la réalité virtuelle avec les simulations moléculaires. Les systèmes biologiques étudiés présentent à la fois un intérêt physico-chimique, biologique et médical et peuvent atteindre un grand nombre d'atomes. En parallèle, je mène un travail de fond sur les méthodes de simulation et des approches novatrices.

Comment fonctionne la DNase I, un agent thérapeutique encore mal connu ?

L'enzyme DNase I, bien connue pour être un outil largement utilisé en biochimie et biologie moléculaire, est utilisée en médecine pour lutter contre la mucoviscidose. Des chercheurs du CNRS ont réussi à comprendre, grâce à des simulations au niveau atomique, le rôle fondamental joué par les ions magnésium et calcium dans le fonctionnement de la DNase I. Ces travaux ont donné lieu à une publication dans la revue PLOS Computational Biology le 18 novembre 2010 et ouvrent la voie à l'amélioration de médicaments à base de cette enzyme.
Plus de détais sur cette partie de mon site.Read more...

Predoctoral opening in the Molecular and Cellular Modeling group at Heidelberg Institute for Theoretical Studies

Predoctoral scholarship in the Molecular and Cellular Modeling group at the Heidelberg Institute for Theoretical Studies (HITS) in Heidelberg, Germany with Prof. Wade.
We are seeking a highly motivated scientist to join the Molecular and Cellular Modeling group at HITS for their doctoral studies. The research project will involve computational modelling and simulation of protein interactions.
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Le GGMM2011 du lundi 30 mai 2011 – mercredi 1er juin 2011 – La Rochelle

Le congrès GGMM 2011 aura lieu du lundi 30 mai 2011 au mercredi 1er juin 2011 à La Rochelle. Parmi les intervenants confirmés il y a Odile Eisenstein, Anne Imberty et Konrad Hinsen. Une page web est mis en place progressivement à l'adresse http://ggmm2011.wordpress.com/. Il s'agit du XVIIe congrès du Groupe de Graphisme et Modélisation Moléculaire. Le congrès se tiendra à La Rochelle, à la Résidence La Fayette. La fin du dépôt des résumés pour les communications orales et par affiches est prévu pour le 1er mars 2011 (cette partie du site n'est pas encore ouverte).
Le congrès GGMM2011 est organisé par Sophie Sacquin-Mora, Marc Baaden, Florent Barbault et Pierre Poulain.

News blog opens! Let's start with a job announcement!

Hi, I decided to add a blog-like news section to the site and will try to update frequently. Let's start with something useful, a job announcement. My colleague Fabio Sterpone has the following position to fillRead more...