Molecular Dynamics - Introduction, Documents, Tutorials

This document in French explains some basics of Molecular Dynamics and lists a number of useful and interesting references.

Ce document "Dynamique Moléculaire in silico" explique les fondements théoriques et donne une liste détaillée de références bibliographiques. Vous pouvez le télécharger ici: Complément de cours de Dynamique Moléculaire (PDF, French).

This tutorial in French covers energy minimization and molecular dynamics in vacuo and in a water box. Some basic visualisation and analysis options are explored. Visualisation uses VMD.

Cet exercice traite de la minimisation d'énergie et de la dynamique moléculaire dans le vide et en solution aqueuse. La visualisation et l'analyse de quelques résultats est abordée. La partie qui concerne la visualisation fait appel au logiciel VMD. Vous pouvez télécharger les documents suivants: Gromacs tutorial main exercise (PDF, French), Gromacs tutorial supplemetary exercise (PDF, French), Gromacs tutorial answers (PDF, French) et Gromacs tutorial files (Archive, tgz).