Marc Baaden

Laboratoire de Biochimie Théorique, CNRS - UPR 9080
13, rue Pierre et Marie Curie
F-75005 Paris
France
Tél.: +33 1 58 41 51 76
Mél.: baaden@ibpc.fr
URL: http://www.baaden.ibpc.fr

Objectif Professionnel

Comprendre au niveau atomique les phénomènes biochimiques par des approches théoriques de la chimie physique, en interaction directe avec des expérimentateurs et avec des techniques telles que la réalité virtuelle.

Formation

• Doctorat Européen en chimie physique / chimie théorique, Novembre 2000, Université Louis Pasteur (ULP), Strasbourg, France et Ecole Polytechnique (ETH), Zürich, Suisse, co-dirigé par le Prof. Georges Wipff et le Prof. Michel Burgard (Strasbourg) comprenant un séjour de 3 mois dans le groupe du Prof. Wilfred van Gunsteren (Zürich): 'Etudes de molécules extractantes en solution et aux interfaces liquide- liquide: aspects structuraux et mécanistiques des effets de synergie.'
• DEA en chimie physique, Septembre 1997, Université Louis Pasteur (ULP), Strasbourg, France, option spectroscopie, sous la direction du Prof. Pierre Granger et du Prof. Alain Strich: 'Calculs ab initio de tenseurs d'écran en RMN.'
• Diplôme d'Ingénieur Chimiste EHICS , Juin 1997, Ecole européenne des Hautes études de l'Industrie Chimique de Strasbourg (EHICS), France, Cursus tri-lingue (Français, Anglais, Allemand) en chimie, option physico-chimie des matériaux.
• 'Diplom-Vorprüfung' en chimie, Avril 1994, Université Technique de Karlsruhe, Allemagne
• 'Abitur' , Juin 1991, Lycée Einstein de Kehl, Allemagne, suivant un cursus bilingue (Allemand/Français).

Recherche

Chargé de Recherche de 1ère classe chez le Prof. Ph. Derreumaux au CNRS Paris (Depuis 2007)

Chargé de Recherche de 2ème classe chez le Dr R. Lavery au CNRS Paris (2003 - 2006, 4 ans)

EC Research Fellow chez le Prof. M.S.P. Sansom à l'Université d'Oxford (GB) (2001 - 2003, 2 ans)

Doctorant chez le Prof. G. Wipff et le Prof. M. Burgard, France (1997 - 2000, 3 ans)

Stage de recherche chez le Prof. W. F. van Gunsteren, Suisse (2000, 3 mois)

DEA chez le Prof. P. Granger et le Prof. A. Strich, Strasbourg, France (1997, 6 mois)

Publications

• 41 publications, 38 communications par affiches, 54 présentations orales, 2 logiciels distribués.

Encadrement

• 17 étudiants en stage de recherche, 3 post-doctorants, 4 doctorants, 4 ingénieurs.

Organisation

• 1 conférence internationale, 1 nationale; 1 école d'été internationale, 1 journée porte ouverte

Relecture d'articles

• JACS, Angewandte, Chemistry, Proteins, Biophys J, PCCP et autres (env. 25 par an)

Bourses

• Bourse ERASMUS de l'Union Européenne (1994)
• Allocation de Recherche du MNERT (26 kEuro, 1998-2000)
• Bourse Marie Curie de l'Union Européenne (114 kEuro, 2001-2003)

Contrats

• FonFlon, 2006 à 2009, 153 kEuro, Fluctuations structurales dans les enzymes
• FlowVRNano, 2008 à 2011, 223 kEuro, Réalité virtuelle et simulations moléculaires
• BioPac, 2010 à 2014, 132 kEuro, Piles à combustibles enzymatiques
• Nico_chimera, 2011 à 2014, en négociation, Récepteur nicotinique et homologues

Contributions scientifiques majeures

• Je suis reconnu pour mon expertise des protéines membranaires. J'ai contribué à plusieurs études d'un canal ionique proche du récepteur nicotinique humain.

Enseignement

Intervenant principalement Université Denis Diderot, Paris 7 (jusqu'à 40 h p.a.) (2003-2010)

Vacataire puis ATER Université Louis Pasteur, Strasbourg (196 h) (1998-99)

Vacataire Ecole de Chimie, Polymères et Matériaux, Strasbourg (104 h) (1997/98)

Autres activités académiques

• Co-organisateur de l'école "BioImage", Paris, Juillet 2005, - http://www.ecole2005.ibpc.fr
  
• Co-organisateur de la conférence "Biomolecular Simulations", Bordeaux, Septembre 2005
  
• Secrétaire Scientifique de la section 13 du Comité National du CNRS
  
• Membre du comité utilisateurs du centre de calcul national IDRIS
  
• Co-auteur du livre "Itinéraires Bis" paru chez Connaissances et Savoirs en 2010
  

Distinctions et Affiliations

• Prix d'excellence de l'EHICS, Strasbourg, France en 1997
  
• Qualification aux fonctions de Maître de conférences (section 31) en 2001
  
• Prix de thèse du Conseil Scientifique de l'ULP, Strasbourg, France en 2001
  
• Prix jeune chercheur du Groupe de Graphisme et Modélisation Moléculaire en 2003
  
• Prix jeune chercheur de la Division de Chimie Physique de la Société Chimique de France en 2010
  
• Membre de la 'Gesellschaft deutscher Chemiker' et de la Société Française de Chimie
  
• Membre de la 'Biophysical Society'
  

Langues

• Français, Allemand - bilingue.
• Anglais - courant (945 points au TOEIC, 23 ans de pratique).
• Japonais - connaissances de base (cours d'initiation de 4 mois au Japon).

Micro-Informatique

Administration système

• Linux, Mac OSX, Unix, Windows.

Réseaux

• TCP/IP (ftp, http, mail), Microsoft, Appletalk.

Programmation

• Objective-C/C, Fortran, Perl, Python et autres

Modélisation Moléculaire

• Gromacs, Yasara, NAMD, Amber, Gromos, Gaussian, Spartan, Macromodel.

Autre

• What If, Modeller, VMD, VTK, R, XML, Docbook, LaTeX.

Bases de données

• PDB, CCDB, Beilstein, bibliographiques (PubMed, ISI, CC, SCI, ...).

Internet

• Création de sites de l'université (ULP), d'un club de sport et personnelles/professionnelles.

Renseignements complémentaires

Centre d'intérêt

• Aïkido et Arts Martiaux (24 ans de pratique, ceinture noire).
• Musique (6 ans de piano).

Voyages

• Europe (A, B, CH, D, E, F, GB, GR, H, I, NL, PL, TR), Afrique (MA), Asie (Japon) et états-unis.