Curriculum Vitae
Marc BAADEN
Né le 23 mai 1972 à Strasbourg (Bas Rhin), vie maritale, deux
enfants
Double nationalité franco-allemande
Situation actuelle
Directeur de Recherche au CNRS (DR1)
Directeur du Laboratoire de Biochimie Théorique (LBT, UPR 9080):
laboratoire de
référence internationale en biophysique théorique, à Paris
Délégué Scientifique à CNRS Chimie (INC, INS 1620): pilotage
stratégique IA/calcul/données, à Paris
Quotités administratives : 80% affecté à l’UPR 9080 et 20 % à l’INS
1620
Occasionnellement actif comme consultant expert (micro-entreprise Baaden
Scientific)
Diplômes, titres universitaires et distinctions
En Allemagne:
- 'Abitur' (1991) suivant un cursus bilingue
(Allemand/Français). Mention Très Bien. Lycée Einstein, Kehl.
- Diplom-Vorprüfung' en chimie (1994). Mention Bien. Université
Technique de Karlsruhe.
En France:
- Diplôme d'Ingénieur Chimiste EHICS (1997), Cursus
tri-lingue (Français, Anglais, Allemand) en chimie,
option physico-chimie des matériaux. Major de la promotion.
- DEA en chimie physique, opt. spectroscopie (1997), Mention Bien. Univ.
Louis Pasteur, Strasbourg.
- Doctorat Européen en chimie physique / chimie théorique (2000), ULP
Strasbourg.
Mention Très Honorable avec les Félicitations écrites du Jury.
- Habilitation à Diriger les Recherches : 10 Juin 2010.
Distinctions - prix:
5 prix scientifiques (1997-2013) + 3 Primes d'Excellence
Scientifique (Prix: excellence EHICS, Strasbourg ‘97; thèse Conseil
Scientifique ULP, Strasbourg ‘01; jeune chercheur Groupe de Graphisme et
Modélisation Moléculaire ‘03; jeune chercheur Division de Chimie
Physique de la Société Chimique ‘10; HP Best presentation
award, Journée Aristote Visualisation Collaborative ’13; PES:
2010-17; 2020-24)
Faits marquants
- CR CNRS (2003) → Directeur LBT (2016) → DR1 (2018)
- 189 publications, H=47, 7577 citations → 12 thèses dirigées
- Vice-président EuroHPC Panel → Expert UE (ERC, Pathfinder) → 10,5 M€
financements
- 10 logiciels distribués (>22 500 téléchargements)
Evolution de la carrière professionnelle
1997 à 2000 : Boursier MNESR avec vacations, puis ATER à l’ULP
Strasbourg
2001 à 2003 : Chercheur post-doctoral (EC Marie Curie Research
Fellow) à l’université d’Oxford, Pr. Sansom
2003 à 2012 : Chargé de Recherche CNRS
au LBT ; 1ère classe en 2007 ; Animateur d’équipe depuis 2007
Depuis 2012 : Directeur de Recherche
CNRS ; 1ère classe en 2018
2015 à 2016: Directeur-adjoint du LBT (Directeur Ph. Derreumaux)
Depuis 7/’16 : Directeur du LBT (actuellement 30
membres, dont 17 permanents)
Depuis 2019: Délégué scientifique à CNRS Chimie (section 15/calcul,
données et IA)
Domaines de compétence
* Biophysique et mécanismes biologiques, en particulier des
protéines membranaires
* Bioinformatique structurale, simulations par dynamique moléculaire et
calcul haute performance
* Visualisation scientifique, réalité virtuelle et simulations
interactives
Publications (>180)
- Revues internationales à comité de lecture :
119 - Chapitres et ouvrages : 11
- Actes de colloques à comité de lecture : 21
- Autre (dont vulgarisation): 38
Animation scientifique: 42 conférences internationales (dont CECAM, Lorentz, 2x Faraday Discussions, VCBM, IEEE VR) et 27 évènements nationaux (dont JTMS, SFCi, ORAP, Aviesan, GGMM, GEM, SFB)
Communications, conférences, séminaires (>340)
- Auteur de 120 conférences et séminaires
invités (dont 56 dans des congrès internationaux)
- Auteur ou co-auteur de 74 communications orales dans
des congrès (25 internationaux et 49 nationaux)
- Auteur ou co-auteur de 151 communications par
affiche
Rayonnement international: expertise pour agences de financement >10 pays, représentant France auprès PRACE/EuroHPC, collaborations actives avec 15 pays (avec publications en commun): USA, Canada, Allemagne, Chine, Autriche, Australie, Espagne, Italie, Japon, Norvège, Rép. Tchèque, UK, Uruguay, Inde, Pays Bas
Encadrement de jeunes chercheurs et activités
d’enseignement
* Direction de recherche et encadrement :
- Direction ou co-encadrement de 12 thèses (11 soutenues) + 12 thésards
autres (> 3 mois)
- 17 stagiaires en M1, 11 en M2 et 33 autres
- 22 post-doctorants (1 encore au laboratoire, 20 en poste)
* Participation aux enseignements :
- plus de 906 heures éq. TD au total ; environ 20 par an
- montage de projets originaux: semaine interdisciplinaire RIGOLE, MOOC
origines de la vie, jeu de plateau Escape from PharmaZ avec application
de réalité augmentée
Sélection de contrats de recherche (exemples au
cours des 5 dernières années)
* Responsable partenaire du projet Aquafoldamer, ANR CE06, 2023 à 2027,
621k€ sur 4 ans.
* Responsable partenaire du projet Merlin, ANR CE45, 2021 à 2025, 609k€
sur 4 ans.
* Responsable partenaire du projet SuperET, ANR CE29, 2021 à 2025, 481k€
sur 4 ans.
* Responsable partenaire du projet MinOmics, ANR CE45, 2019 à 2024,
559k€ sur 4 ans.
* Responsable scientifique d’un projet recherche/industrie avec UCB
Biopharma, Belgique, 2016 à 2021, 199k€.
10.5 M€ de financements sur la carrière dont 14 projets ANR et collaborations industrielles internationales, implication dans le montage des projets LABEX DYNAMO et EQUIPEX CACSICE et EU COFUND.
Innovation et développements logiciels: 10 solutions logicielles sont distribuées à la communauté scientifique, certaines soutenues par l’industrie: MolPlay, MDDriver, BioSpring, Epock, MDVerse et UnityMol, avec >22’500 téléchargements et plusieurs prix (Sourceforge Community Award, Prix Science Ouverte 2024).
Activités de Gestion: Responsabilités collectives et
principales activités d’expertise
* Au laboratoire: - directeur du Laboratoire depuis 2016
(directeur-adjoint depuis 2015)
- responsable d’équipe depuis 2007 (taille fluctuante, 2 à 8
non-permanents)
- membre du Conseil de Laboratoire depuis 22 ans
* A l’université: - membre du Conseil Scientifique de l’UFR Sciences du
Vivant (2017 et 2018)
- responsable de l’EAD pour l’ED 388
- membre de comités de sélection 4x IR/IE/AI, 7x MCF/Prof/CPJ (S31 et
S64)
- membre de 59 jurys de thèse, 8 de HDR, 4 de prix, 4 de stages, pour 10
pays
* Au plan national: - délégué scientifique, CNRS Chimie (COPILs DDOR et
AISSAI, interface CECAM ..)
- vice-président du comité ANR TSIA 2025 (IA en chimie/physique)
- membre du Comité National de la Recherche Scientifique (section 13,
2008-2012)
- membre de comités de visite de l’HCERES (2016 à 2025)
- président du comité CT7 d’attribution d’heures de calcul de GENCI 2014
à 2020
- président de la société savante GGMM de 2013 à 2015
- membre élu au bureau du GDR3333 (relation avec les centres de calcul)
depuis 2018
- membre du CS de la société savante «Groupe d’Etude des Membranes»
depuis 2011
* Au plan international: - expert et auditeur récurrent pour l’UE (ERC,
PathFinder, ERN/ACSA/IDOM)
- membre du Scientific Advisory board des projets ScalaLife, puis
BioExcel depuis 2012
- représentant de la France auprès du PRACE Access Committee depuis
2016;
Vice-président du comité depuis 2019; Maintenant EuroHPC Panel
Vice-Chair
- expert pour des agences de financement de la recherche (>10
pays)
- référé dans plusieurs revues internationales (env. 25 articles/an)
Expertise et conseils: formalisé depuis 2020 par mon entreprise Baaden Scientific. Environ 5 clients internationaux majoritairement, dont des grands groupes.